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Márcio Navalho iniciou a sua carreira de Investigação em 1996, ainda estudante do 2º ano da Licenciatura em Medicina, como Investigador do Departamento de Bioquímica da Unidade de Biopatologia Vascular da FML (1996 a 2001), trabalhando proximamente com vultos da Investigação na área da Bioquímica, como o Prof. Doutor Martins e Silva e Prof.ª Doutora Carlota Saldanha.

Entre 2001 e 2008 transita para a Unidade de Biologia Microvascular do IMM, onde desenvolve trabalho de investigação básica, clínica e de translação, nomeadamente na área de Imagiologia.

Passa a colaborar ativamente com a Unidade de Investigação em Reumatologia do IMM, onde permanece entre 2008 e 2015, colaborando com líderes da investigação nesta área, como a Prof.ª Doutora Helena Canhão e Prof. Doutor João Eurico Fonseca.

É precisamente nesta Unidade que desenvolve a sua Investigação de Doutoramento em Medicina, especialidade de Imagiologia, na área da Imagiologia Reumatológica e sob orientação da Prof.ª Doutora Helena Canhão e Prof. Doutor Jorge Campos. Daqui se obtém o seu trabalho de maior impacto, a primeira documentação inequívoca, por Ressonância Magnética, da importância da tenossinovite no diagnóstico da Artrite Reumatóide Precoce ou Muito Precoce; trabalho publicado na Revista de maior impacto mundial em Radiologia, a Radiology, o trabalho estaria na génese de alterações de sistemas de diagnóstico de classificação de scoring e de livros de texto sobre a doença, perdurando ainda hoje fortemente o seu impacto e sendo a base de investigação subsequente por diversos grupos de trabalho: Bilateral MR imaging of the hand and wrist in early and very early inflammatory arthritis: tenosynovitis is associated with progression to rheumatoid arthritis.

Desde 2018 é Investigador do Comprehensive Health Research Center, nos grupos de Músculo-Esquelético e Inovação em Saúde. Neste momento lidera trabalho de Investigação no campo da inteligência artificial e redes convolucionais neuronais complexas aplicadas à Radiologia, sendo o seu âmbito de interesse por excelência a saúde digital nas suas múltiplas valências.

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